В марте 2016 года суд приговорил его к девяти годам и двум месяцам колонии за умышленное причинение тяжкого вреда здоровью, повлёкшее по неосторожности смерть, и нанесение побоев из хулиганских побуждений.
Напомним, что в ночь с 29 на 30 декабря 2015 года в больницу обратился Евгений Вахтин с подозрением на желудочное кровотечение. Пациент якобы ударил ногой медсестру, и та пожаловалась на это Зелендинову, после чего мужчина ударил Вахтина и сопровождающего его Александра Авилова. Последний отделался синяками, а Евгений Вахтин скончался на месте после удара головой об пол.
Отметим, что сначала хирурга обвиняли в причинении смерти по неосторожности, однако после общественного резонанса ему было предъявлено обвинение по более «тяжёлой» статье «Умышленное причинение тяжкого вреда здоровью, повлёкшее по неосторожности смерть потерпевшего» (на ч. 4 ст. 111 УК РФ). Если ранее врачу грозило до двух лет лишения свободы, то после переквалификации дела он получил 9 лет и 2 месяца.
По словам белгородского адвоката Бориса Золотухина, основанием для квалификации действий Зелендинова по этой статье стал факт удара в область каротидного синуса, вызвавшего рефлекторную остановку сердца. В качестве доказательства намерения ударить именно в эту точку суд указал на действия хирурга во время конфликта (нанесение удара в жизненно-важные органы — в лицо и шею), наличие у него опыта врача и знание анатомии тела. Сам осужденный отрицал намерение попасть в эту точку.
Также родственники умершего мужчины требовали от больницы компенсации морального ущерба в размере 7,5 млн рублей: три миллиона – в пользу супруги, три – в пользу дочери, полтора – в пользу внучки. Однако суд отклонил иск.
До 2021 года бывший доктор отбывал наказание в Валуйской колонии строгого режима ИК-7, где получил 14 поощрений за хорошее поведение, добросовестное отношение к труду и активное участие в спортивно-массовых мероприятиях. В январе 2021 года суд перевёл Зелендинова в Алексеевскую колонию ИК-4 на принудительные работы, где он и подал прошение об условно-досрочном освобождении. Суд удовлетворил ходатайство, Зелендинов должен выйти из тюрьмы уже 19 августа, то есть на три года раньше. Также суд освободил врача от отбывания дополнительного вида наказания в виде лишения права заниматься медицинской деятельностью и обязал его в течение месяца устроиться на работу.